As bactérias são organismos unicelulares procarióticos, ou seja, elas são constituídas por uma única célula que não possui núcleo. Esses apresentam morfologia diferentes, que é a forma que bactéria possui e que é dada pela sua parede celular.

De acordo com dua forma as bactérias podem ser divididas em cocos, bacilos, espiroquetas e vibriões. As bactérias com formatos arredondados são chamadas de cocos, elas podem também formar arranjos, sendo assim denominados diplococos (dois cocos reunidos), estafilococos (forma de cachos de uva), estreptococos (cocos enfileirados), Sarcina (aspecto cúbico) ou tétrades (arranjados em pares de quatro).

Os bacilos apresentam estruturas alongadas em forma de bastão, quando possuem formato curvo são chamamos de vibrião.

Há ainda um tipo chamado cocobacilo, que é assim chamado por apresentar uma estrutura intermediária entre cocos e bacilos.

Outro tipo morfológico de bactérias são os espirilos ou espiroquetas, assim chamados por apresentam forma espiralada. Como representantes deste tipo, temos bactérias da leptospirose e da sífilis.

A parede celular é a camada mais externa à membrana citoplasmática da bactéria e, por ser rígida, é a estrutura responsável por dar a forma das bactérias. Ela também atua como uma barreira química e física contra agentes externos. As bactérias podem ser divididas em Gram-negativas e Gram-positivas, de acordo com a coloração que ela vai adquirir nos métodos laboratoriais, e são diferenciadas através da

composição da parede celular. A diferença básica entre elas é que a gram-positiva apresenta uma camada espessa de peptideoglicano, já a gram-negativa apresenta duas camadas: uma camada mais externa (formada de fosfolipídeos) e uma segunda camada, contendo uma camada fina de peptideoglicanos. 

Nas bactérias gram-positivas, mais ou menos 90% da parede é composta por esses peptideoglicanos, enquanto nas gram-negativas pelo lipopolissacarídeo (LPS). A camada externa se localiza na parte mais superficial da célula e é chamada de Membrana externa. Esta funciona como uma barreira de permeabilidade para as grandes moléculas e também fornece proteção contra o organismo do hospedeiro. É nessa face externa que se encontra o lipopolissacarideo (LPS), que é uma endotoxina que provoca uma resposta exacerbada do sistema imune do hospedeiro, induzindo febre, pela produção de citocinas e pode levar ao choque séptico. Por isso que o grupo de bactérias gram-negativas é considerado mais patogênico que as gram-positivas. 

Entre a membrana externa e a membrana citoplasmática das bactérias gram-negativas, há um espaço que armazena enzimas importantes, como fatores de virulência e enzimas relacionadas à resistência bacteriana, tendo sua ação otimizada por estar numa região mais superficial da célula, garantindo uma melhor proteção da célula bacteriana. Este espaço é chamado de Espaço periplasmático e é nele em que se encontra a fina camada de peptideoglicano.

Cabe lembrar que nem todas as bactérias possuem parede celular. Algumas bactérias, como o gênero micoplasma por exemplo, não possuem essa parede, o que torna ainda mais difícil o seu combate, visto que a parede celular é o local de atuação de importantes antimicrobianos.